Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PP2D1A8MPX8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms