Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HELTA6NFD8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms