Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L4A6NEF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms