Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6CA6NDK9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6CA6NDK9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms