Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP17L4A6NCW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP17L4A6NCW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms