Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XIRP2A4UGR9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms