Protein–RNA interactions for Protein: A4QPH2

PI4KAP2, Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP2A4QPH2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP2A4QPH2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP2A4QPH2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PI4KAP2A4QPH2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PI4KAP2A4QPH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms