Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SSPOA2VEC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SSPOA2VEC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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