Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC66A2RUB6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC66A2RUB6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms