Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0J9YXV3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0J9YXV3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms