Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF3-204ENST00000405493 5751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SPIN3-223ENST00000639525 3958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 INTS14-203ENST00000431261 1980 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC016831.5-201ENST00000605249 1998 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CASP7-203ENST00000369318 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TRIM40-206ENST00000376724 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GP1BA-201ENST00000329125 2501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 COL14A1-203ENST00000309791 6163 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GRHL3-202ENST00000350501 2119 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SMIM3Q9BZL3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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