Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC27P30260 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC27P30260 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC27P30260 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms