Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.2 ms