Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GPR26-201ENST00000284674 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ITGA7-213ENST00000555728 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 KCNJ3-203ENST00000544049 4523 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF4-201ENST00000326016 3666 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC087741.1-201ENST00000570309 4399 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SULF2-211ENST00000484875 4238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms