Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK8P49336 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms