Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 OR10N1P-203ENST00000641736 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPOP42166 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPOP42166 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CFAP157-202ENST00000373295 1721 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPOP42166 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms