Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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GCAP28676 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 ITGAX-204ENST00000562918 1521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCAP28676 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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GCAP28676 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCAP28676 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCAP28676 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCAP28676 PSG9-201ENST00000244293 2073 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCAP28676 TMEM100-205ENST00000575734 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCAP28676 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCAP28676 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCAP28676 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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