Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 CCDC129-201ENST00000319386 4544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TMEM225BP0DP42 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms