Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MASTL-201ENST00000342386 2968 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PMEPA1-203ENST00000347215 4546 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC079779.1-201ENST00000437798 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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