Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TMEM136-201ENST00000314475 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 KCNAB1-203ENST00000389636 1806 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SELENOS-207ENST00000531964 764 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LINC01503-201ENST00000423122 545 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AC005102.1-201ENST00000403118 479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 DNAL4-202ENST00000406199 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIRT1Q96EB6 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms