Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK8P49336 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDK8P49336 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms