Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
U3KQV3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U3KQV3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U3KQV3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U3KQV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
U3KQV3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
U3KQV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
U3KQV3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms