Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUBP2Q9Y5Y2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms