Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR2E3Q9Y5X4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR2E3Q9Y5X4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms