Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CDC42BPBQ9Y5S2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CDC42BPBQ9Y5S2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CDC42BPBQ9Y5S2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms