Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms