Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms