Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSAG2Q9Y5P2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSAG2Q9Y5P2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms