Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFE2L3Q9Y4A8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFE2L3Q9Y4A8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFE2L3Q9Y4A8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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