Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HDGFL3Q9Y3E1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms