Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN22Q9Y2R2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN22Q9Y2R2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms