Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFR3BQ9Y2G0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFR3BQ9Y2G0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms