Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOD1Q9Y239 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NOD1Q9Y239 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOD1Q9Y239 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms