Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNEQ9Y223 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GNEQ9Y223 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNEQ9Y223 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms