Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms