Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms