Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCPG1Q9ULG6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCPG1Q9ULG6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms