Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH7Q9ULB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH7Q9ULB5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms