Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NRXN1Q9ULB1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NRXN1Q9ULB1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NRXN1Q9ULB1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms