Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA3Q9UL41 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA3Q9UL41 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms