Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms