Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM4Q9UKN5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM4Q9UKN5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms