Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHIC2Q9UKJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC2Q9UKJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms