Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FBXL4Q9UKA2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXL4Q9UKA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms