Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP21Q9UK80 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP21Q9UK80 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms