Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIX4Q9UIU6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms