Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA3Q9UI47 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA3Q9UI47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms