Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCSK1NQ9UHG2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms