Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPC1L1Q9UHC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NPC1L1Q9UHC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NPC1L1Q9UHC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPC1L1Q9UHC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPC1L1Q9UHC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms