Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTNAP2Q9UHC6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms